基于线粒体COII基因序列的长江下游翘嘴鲌群体遗传多样性分析

摘要：

[目的]明确长江下游翘嘴鲌(Culter alburnus)群体遗传多样性的丰富程度和进化历史,为其育种及遗传改良打下基础.[方法]在长江下游水域(淀山湖、高邮湖、太湖、长荡湖及长江江苏段)设点捕获收集翘嘴鲌野生样本,基于线粒体COII基因序列分析5个翘嘴鲌野生群体的遗传多样性,使用DNASPv5计算群体单倍型并进行Tajima's D和Fu's Fs中性检验,运用Arlequin 3.5进行遗传多样性分析、群体分子方差分析(AMOVA)及计算遗传距离和基因流(Nm).[结果]5个翘嘴鲌野生群体197个个体的COII基因序列有效长度为425 bp,存在31个变异位点,变异率为7.29％;其碱基含量排序为T(29.61％)>C(28.03％)>A(24.19％)>G(18.17％),AT含量为53.8％,CG含量为46.2％.31个变异位点在197个个体中共定义出13种单倍型(hap1～hap13),单倍型多样性指数(Hd)为0.273～0.603,以长江群体和长荡湖群体的最高,太湖群体的最低;核苷酸多样性指数(Pi)为0.001～0.017,以长荡湖群体的最高,淀山湖群体的最低.5个翘嘴鲌野生群体间的遗传距离为0.002～0.015,即群体间无显著差异;不同群体间的Nm为2.443～54.325,以太湖群体与淀山湖群体间的Nm最大(54.325),长荡湖群体与淀山湖群体间的Nm最小(2.443);AMOVA分析结果显示,不同群体间的遗传变异为10.47％,而群体内的遗传变异为89.53％.在5个翘嘴鲌野生群体中,仅长江群体的Tajima's D和Fu'Fs均为负值且具有显著意义,故推测该群体曾发生过群体扩张现象.[结论]长江下游翘嘴鲌群体表现出低单倍型多样性和高核苷酸多样性,遗传多样性较丰富,群体间存在遗传分化但分化程度差异不显著.因此,后续研究应增加野生翘嘴鲌群体的样品数量和调查水域,全面而系统地评估长江下游各水域翘嘴鲌的种质资源状况,为建立自然保护区及人工增殖放流提供科学依据.

关键词：翘嘴鲌、COII基因、遗传多样性、遗传分化、长江下游水域

所属期刊栏目：53

分类号：S965.123(水产养殖技术)

资助基金：中国水产科学研究院基本科研业务费专项;江苏省水生野生动物普查专项

在线出版日期：2022-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2025-2032