芒果VOZ转录因子基因家族成员鉴定及生物信息学分析

摘要：

[目的]对芒果维管束锌指蛋白(VOZ)基因家族成员进行鉴定并对其生物信息学进行分析,为深入探究芒果VOZ转录因子在免疫反应中的生物学功能提供理论参考.[方法]基于芒果全基因组数据,利用生物信息学方法鉴定芒果VOZ转录因子基因家族成员,并分析其理化性质、保守基序及系统发育进化.通过实时荧光定量PCR检测胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)与细菌性黑斑病菌(Xanthomonas citri pv.mangiferaeindicae)侵染下的相对表达量.[结果]从芒果全基因组中间鉴定出4个VOZ转录因子家族成员,分别为MiVOZ1、MiVOZ2、MiVOZ3和Mi-VOZ4基因,开放阅读框(ORF)长度为1290～1482 bp,编码氨基酸数量为429～493,蛋白分子量为47.26～54.96 kD,等电点(pI)为5.47～6.00,亲/疏水性指数为-0.663～-0.552,不稳定指数为37.66～50.86,二级结构均以无规则卷曲和α-螺旋为主要元件.芒果和其他9个物种的49个VOZ蛋白聚为十个分支,在ClassⅠ中3个MiVOZs蛋白(MiVOZ2、MiVOZ3和MiVOZ4)与苹果、木薯和毛果杨聚类在一起,在ClassⅤ中MiVOZ1与拟南芥、木薯和毛果杨聚类在一起.在胶孢炭疽菌侵染下,仅MiVOZ1和MiVOZ2基因的相对表达量较对照显著升高(P<0.05,下同);在细菌性黑斑病菌侵染下,仅MiVOZ2基因的相对表达量较对照显著升高.[结论]芒果VOZ转录因子在抵御不同病原菌侵染的生物学功能方面存在差异,其中MiVOZ2基因在抵御胶孢炭疽病和细菌性黑斑病侵染的免疫反应中具有相似生物学功能,属于正调节因子.

关键词：芒果;VOZ转录因子;生物信息学;实时荧光定量PCR

所属期刊栏目：52

分类号：S667.703.6(果树园艺)

资助基金：国家重点研发计划项目;中国热带农业科学院基本科研业务费专项

在线出版日期：2021-10-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1762-1770