贵州芸薹黄化病毒的分子检测及基因型鉴定

摘要：

[目的]对贵州省白菜、萝卜和甘蓝感染芸薹黄化病毒(Brassica yellows virus,BrYV)进行分子检测及基因型鉴定,为马铃薯卷叶病毒属病毒的防治提供理论参考.[方法]在贵州省遵义市、威宁县、关岭县、平坝县等县(市)共采集284份蔬菜(白菜、萝卜和甘蓝)疑似病毒病样品,利用马铃薯卷叶病毒属的通用引物进行RT-PCR分子检测,并对检测出的16个BrYV分离物进行P0和CP基因序列扩增,再与已报道的BrYV基因序列进行比对,从而构建系统发育进化树,鉴定其基因型.[结果]284份疑似病毒病样品中,有43份样品检测出BrYV,检出率为15.14％,其中,感染BrYV白菜样品12份,占白菜总样品数的12.77％;感染BrYV萝卜样品14份,占萝卜总样品数的20.29％;感染BrYV甘蓝样品17份,占甘蓝总样品数的14.05％.贵州16个BrYV分离物P0基因核苷酸序列的相似性为89.9％～100.0％,CP基因核苷酸序列的相似性为93.5％～100.0％,二者编码的氨基酸序列相似性均为100.0％.基于P0基因构建的系统发育进化树可知,BrYV-Pingba-BC-2、BrYV-Zunyi-LB-1和BrYV-Zhijing-BC-1均与BrYV-BJS和BrYV-BBJ聚为一类,其余13个分离物均与BrYV-ABJ和BrYV-AJS聚为一类.基于CP基因构建的系统发育进化树可知,贵州不同地区不同蔬菜作物的16个BrYV分离与BrYV-A和BrYV-B基因型无明显分界,亲缘关系均较近.BrYV P0基因检测到5个重组事件,BrYV CP基因未检测到潜在重组事件.[结论]BrYV在贵州白菜、萝卜和甘蓝上普遍发生,但对萝卜的危害最重,主要存在BrYV-A和BrYV-B 2种基因型.

关键词：芸薹黄化病毒(BrYV);十字花科蔬菜;基因型鉴定;分子检测;系统进化

所属期刊栏目：52

分类号：S436.3(病虫害及其防治)

资助基金：贵州省科技支撑计划项目;贵州省基础研究计划项目;贵州农业科学院青年科技发展基金项目

在线出版日期：2021-08-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1149-1157