基于两种电泳检测方法的华东野生菰ISSR遗传多样性分析

摘要：

[目的]筛选更优的ISSR-PCR扩增产物电泳检测方法,分析我国华东地区野生菰种质资源遗传多样性,为建立和完善菰植物种质库及合理开发与利用菰资源提供理论依据.[方法]挑选7条ISSR引物对华东地区9个野生菰居群104份材料基因组DNA进行PCR扩增,其ISSR-PCR产物分别采用2％琼脂糖凝胶电泳和5％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测.[结果]2％琼脂糖凝胶电泳检测结果显示,华东地区野生菰的多态性位点百分率(PPB)为63.49％、观测等位基因数(Na)为1.6349、有效等位基因数(Ne)为1.3012、Nei's基因多样性指数(He)为0.1871、Shannon's信息指数(I)为0.2908、居群间遗传分化系数(Gst)为0.3922、遗传相似系数(Gs)变化范围在0.8293～0.9775;其聚类分析结果表明,当遗传相似性系数阈值为0.885时,9个野生菰居群被分为两大类,SH(上海)和PYH(鄱阳湖)居群归为一类,其他7个居群归为另一类.5％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果显示,华东地区野生菰的PPB为78.03％、Na为1.7803、Ne为1.2762、He为0.1804、I为0.2914、Gst为0.5086、Gs变化范围在0.7679～0.9837;其聚类分析结果表明,当遗传相似性系数阈值为0.850时,9个居群也被分为两大类,其中PYH居群单独为一类,其他8个居群归为另一类.[结论]我国华东地区野生菰种质资源遗传多样性丰富,居群间和居群内变异显著,基于ISSR分子标记的野生菰遗传多样性采用5％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测可获得更可靠的遗传图谱,而2％琼脂糖凝胶电泳检测更适合早期的ISSR分子标记引物筛选.

关键词：野生菰、ISSR分子标记、遗传多样性、琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳、华东地区

所属期刊栏目：50

分类号：S519;Q943(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金项目;国家转基因生物新品种培育重大专项

在线出版日期：2020-06-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2638-2646