基于CGE技术的甘蔗SSR-PCR反应体系优化

摘要：

【目的】优化基于毛细管凝胶电泳（CGE）技术的甘蔗SSR-PCR反应体系，为甘蔗遗传多样性和亲缘关系研究、分子辅助育种及遗传图谱构建提供技术支持。【方法】基于CGE技术，采用正交试验设计，选择dNTPs浓度、DNA聚合酶量、引物浓度和DNA模板量为考察因素进行优化，确定最佳SSR-PCR反应体系，并用于8个甘蔗种质资源材料的遗传多样性分析。【结果】最佳SSR-PCR反应体系（20μL）：dNTPs浓度0.15 mmol/L，DNA聚合酶1.5 U，引物浓度0.50μmol/L，DNA模板量25 ng。利用该体系对8份来自不同国家地域的甘蔗种质材料进行遗传多样性分析，发现8对SSR引物共扩增出101个片段，其中多态性片段为93个，多态性比率为92.1%。聚类分析结果表明，参试材料间的遗传相似性系数为0.521~0.871，在相似性系数为0.614处，所有参试材料可分为两大类，3份国外种质材料PINDAR、CP72-1210、CP84-1198与ROC20、GT69-156聚为一类；而ROC26、GT02-237和GT97-69聚为另一类。【结论】基于CGE技术的SSR-PCR反应体系检测结果稳定，重复性好，适用于甘蔗的遗传分析及遗传作图。

关键词：甘蔗、SSR分子标记、毛细管凝胶电泳(CGE)、反应体系、遗传分析

所属期刊栏目：47

分类号：S566.1(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金项目31560415；八桂学者工程专项项目[2013]3号；广西自然科学基金项目2015GXNSFBA139095；广西农业科学院基本科研业务费专项项目2015YT03

在线出版日期：2016-11-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1463-1469