广西鹅圆环病毒全基因组序列测定

摘要：

[目的]解析鹅圆环病毒(Goose Circovirus,GoCV)广西流行毒株的全基因组序列及其遗传进化地位,掌握广西GoCV的流行情况,为今后更有效防控GoCV提供理论依据.[方法]分3段对阳性组织样品中的GoCV全基因组进行PCR扩增、克隆和测序,并对拼接得到的GoCV广西流行毒株全基因组进行核苷酸组成、基因组结构及遗传变异分析.[结果]GoCV广西流行毒株(GXTD254)全基因组长度为1822 nt,编码4个主要开放阅读框:ORFV1(Rep蛋白,293个氨基酸)、ORF V2(37个氨基酸)、ORF C1(Cap蛋白,250个氨基酸)和ORF C2(99个氨基酸),且Rep蛋白较Cap蛋白相对保守.遗传进化分析结果表明,GXTD254毒株与4株浙江永康分离毒株(ZJyk1、ZJyk2、ZJyk3和ZJyk4)、1株浙江象山分离毒株(ZJxs1)的遗传距离最接近,同属于一个遗传分支,但与我国台湾的大多数分离毒株(TW1021024G、TWGB21-9、TW6、TW9、TW8和TW1020111GB)及另外2株浙江象山分离毒株(ZJxs3和ZJxs5)的遗传距离较远.[结论]目前我国流行的GoCV存在多个分支,广西流行毒株与部分浙江分离毒株在亲缘关系上比较接近.

关键词：鹅圆环病毒、全基因组、序列分析、Rep蛋白、Cap蛋白

所属期刊栏目：47

分类号：S858.33(动物医学（兽医学）)

资助基金：广西自然科学基金项目2012GXNSFAA053073;广西水产畜牧兽医局科技计划项目桂渔牧科1204936

在线出版日期：2016-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：122-127