玉米MIR166基因家族的进化与功能研究

摘要：

[目的]分析玉米MIR166基因家族的序列特征、分子进化及靶基因等,了解MIR166基因家族在玉米生长发育与逆境胁迫响应中的调控作用.[方法]运用生物信息学方法在miRBase中搜索zma-MIR166基因家族的序列,用BLAST搜索工具进行基因定位;采用ClustalW2软件进行多序列比对,用MEGA 6.0构建zam-MIR 166家族的系统发育进化树;利用psRNATarget软件对zma-MIR166基因家族的靶基因进行预测.[结果]通过搜索,在玉米中找到14个zma-MIR 166基因,并获得其对应的14个前体序列及由其产生的26个成熟miRNA序列.zma-MIR 166基因家族在产生成熟miRNA的位置高度保守,其他位置则保守性减弱.基因定位结果发现,zma-MIR 166基因家族的14个成员分布在染色体1、3、4、5、6、7等6条染色体上,其中以染色体1上zma-MIR 166基因最多,共有5个.进化分析结果表明,14个zma-MIR166基因家族成员分别处于3个进化分支,而同处于一条染色体上的成员的亲缘关系较远.对zam-MIR166基因家族的靶基因进行预测,发现zma-MIR 166基因家族靶基因功能涉及发育调控蛋白家族、胁迫相关蛋白、光系统Ⅰ作用中心亚基、转座子插入位点等.[结论]zam-MIR166基因家族序列保守性较高,具有明显的家族特征与相似的功能,在玉米生长发育和胁迫响应等生物过程中发挥广泛而重要的调控作用.

关键词：玉米、MIR166、基因家族、分子进化、靶基因预测

所属期刊栏目：46

分类号：S513(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金项目31201199;山东省自然科学基金项目ZR2013CL013;水稻生物学国家重点实验室开放项目120201

在线出版日期：2015-12-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1345-1349