巴西橡胶NBS-LRR抗病基因类似物多样性分析

摘要：

[目的]克隆巴西橡胶抗病基因同源序列,为巴西橡胶抗病R基因的获取奠定基础.[方法]根据已知抗病基因(Resistance gene,R gene)编码的蛋白质NBS-LRR保守结构设计一对简并引物P1/P2,采集经水杨酸(SA)处理0、12、24、48 h的巴西橡胶叶片,进行cDNA同源序列克隆.[结果]序列分析结果表明,克隆获得的RGAs经系统进化分析分为TIR-NBS-LRR和non-TIR-NBS-LRR两种类型和9个基因家族；多重比较发现,克隆获得的RGAs具有典型的NBS类抗病基因保守结构域,在与已知植物NBS类序列相似性比较中,与I2c-2基因相似性最高,为46.2％,而巴西橡胶NBS类RGAs之间氨基酸相似性为22.1％～100.0％.进一步研究发现,核苷酸非同义替换和同义替换的比率小于1,有低水平的重组,表明点突变逐步积累是导致纯化选择的主要力量.[结论]通过SA诱导作用和NBS类抗病基因结合得到的巴西橡胶NBS类RGAs具有广泛的遗传多样性,并与已知抗病基因氨基酸序列具高度相似性,这些RGAs候补序列可能与某抗病基因有密切联系.

关键词：巴西橡胶、水杨酸、NBS-LRR、抗病基因同源序列(RGAs)、核苷酸结合位点(NBS)

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分类号：S794(森林树种)

资助基金：海南大学"211工程"热带作物遗传育种与生态保育创新人才培养基金项目YJS-2011-0210

在线出版日期：2013-07-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：371-376