干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库构建及EST序列分析

摘要：

[目的]构建甘蔗根系全长cDNA文库,并进行测序,为分离克隆甘蔗抗旱候选基因奠定基础.[方法]在干旱胁迫条件下,以新台糖22号甘蔗根系为材料,采用SMART技术构建cDNA文库,并进行EST序列分析.[结果]文库构建质量鉴定结果显示,文库库容量为1.0×106 PFU/mL,重组率约95％,文库插入片段长度在500～2000 bp,平均长度约1102.1 bp.挑选526个阳性克隆进行单向测序后,共获得523个ESTs序列,去除载体、接头序列以及长度低于100 bp的序列后,进行聚类分析并组装,共得到468个Uni-ESTs,其中congtig 29个,singlets 439个,分别占总数的6.5％和93.5％.通过与NCBI非冗余蛋白库进行BLASTX比对,发现444个Uni-ESTs在GenBank有同源序列,占94.87％;获得24个未知蛋白功能基因,占5.13％.[结论]构建了干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库,获得523个ESTs序列和468个Uni-ESTs,并获得一批新的未知蛋白功能基因.

关键词：cDNA文库、甘蔗、根系、表达序列标签、测序

所属期刊栏目：43

分类号：S566.1(经济作物)

资助基金：广西自然科学基金创新研究团队项目2011GXNSFF018002;广西科学研究与技术开发计划项目桂科攻10100005-9;广西科学基金项目桂科基0778006-6,桂科基0832026,2010GXNSFA013102;广西科学基金项目应用基础研究专项项目桂科基0991021;广西农业科学院基本科研业务专项项目[200803Z;200902Z基];广西农业科学院科技发展基金项目2007023;广西重点实验室建设项目12-071-09

在线出版日期：2012-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：733-737