广西猪瘟病毒E2基因克隆及序列分析

摘要：

[目的]了解广西猪瘟病毒(CSFV)流行毒株的变异规律及其与疫苗株的基因差异,为正确选择猪瘟疫苗和防制广西猪瘟提供参考依据.[方法]以广西本地的阳性猪瘟病料为研究对象,应用RT-PCR扩增CSFV的E2基因,经克隆、测序后用DNASTAR软件对其序列进行比对分析,并绘制遗传进化树.[结果]从41份疑似猪瘟病料中共扩增出4个阳性样品的E2基因(1140 bp),经序列比对分析发现,扩增获得的4株CSFV毒株(GXGG1、GXLC1、GXLC2和GXNN1)与兔化弱毒株(HCLV)、Shimen强毒株的核苷酸同源性为82.1％～82.3％和82.9％～83.4％、其推导氨基酸同源性为88.4％～89.2％和88.9％～90.0％,4株毒株间的E2基因核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为90.8％～99.6％和94.2％～99.5％,且均属于基因群Ⅱ；E2基因推导的氨基酸表明,E2蛋白空间结构及抗原结构的氨基酸位点693Cys、737Cys、792Cys、818Cys、828Cys、856Cys、833Pro、834Thr、837Arg均未发生变异,但其单抗识别位点G713E、N729D、K734R发生变异.[结论]近年来广西CSFV流行毒株的变异未出现较大差异.与HCLV株、Shimen强毒株亲缘关系较远,但与Paderborn株、GXWZ02株亲缘关系较近.

关键词：猪瘟病毒、E2基因、序列分析、同源性、氨基酸变异、广西

所属期刊栏目：43

分类号：S858.28(动物医学（兽医学）)

资助基金：广西科学研究与技术开发计划项目桂科攻1123007-3

在线出版日期：2012-09-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：528-531