PCR-DGGE技术在水牛瘤胃产甲烷菌多样性分析中的应用

摘要：

[目的]分析水牛瘤胃产甲烷菌的多样性,为更好地了解水牛瘤胃产甲烷菌提供科学依据.[方法]采集16头广西本地沼泽型水牛瘤胃内容物,提取总DNA,利用产甲烷菌的通用引物扩增16S rRNA基因序列进行DGGE分析,并对DGGE凝胶上7条优势条带进行回收克隆测序.[结果]共获得9条序列(5条为古菌序列、4条为非古菌序列),5条古菌序列中有3条与甲烷短杆菌(Methanobrevibacter)的同源性高达99％、1条与甲烷短杆菌的同源性达98％、1条与广古菌门 ( Euryarchaeota)热原体目(Thermoplasmatales)的同源性达98％；而4条非古菌序列分别属于拟杆菌(Bacteroidetes)、厚壁菌(Firmicutes)、变形菌门 (Proteobacteria),且彼此间同源性较小.[结论]通过PCR-DGGE技术可以较好地分析水牛瘤胃产甲烷菌的多样性.

关键词：水牛、瘤胃、产甲烷菌、PCR-DGGE、多样性分析

所属期刊栏目：42

分类号：S823.8+3(家畜)

资助基金：广西大学研究生创新计划项目2007105930905M079

在线出版日期：2012-01-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1144-1147