凡纳滨对虾类泛素折叠修饰蛋白Ufm1基因克隆、序列分析及结构预测

摘要：

[目的]了解类泛素折叠修饰蛋白(Ufm1)的结构特征和蛋白功能,为进一步探究Ufm1基因功能提供参考.[方法]以同一生长性状分离凡纳滨对虾家系的肌肉组织为材料,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,通过斑点杂交筛选获得Ufm1基因,经全长cDNA文库筛选获得Ufm1基因全长序列.[结果]Ufm1基因全长cDNA序列长714 bp,包含261 bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质为86个氨基酸,预测的分子量为9.3 ku,等电点pI为6.55;其编码蛋白无信号肽,无跨膜区域,可能定位于细胞质中,属于亲水性蛋白,含有1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、1个N-糖基化位点、2个蛋白激酶C磷酸化位点;序列同源性分析表明,不同进化地位物种的Ufm1基因存在较高的同源性.[结论]Ufm1基因在系统进化上高度保守,这为进一步探究Ufm1基因功能及原核表达等奠定了基础.

关键词：凡纳滨对虾、差减cDNA文库、Ufm1基因、生物信息学

所属期刊栏目：42

分类号：S945.1(水产保护学)

资助基金：国家科技支撑计划项目2008BADB9B03;国家虾产业技术体系岗位科学家经费项目nycytx-46;广西直属公益性科研院所基本科研业务项目2060302GXIF-2008-02

在线出版日期：2011-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：192-196