基于网络药理学、分子对接及分子动力学模拟探讨黄连治疗溃疡性结肠炎的作用机制

摘要：

目的 通过网络药理学、分子对接和分子动力学模拟(MD)探讨黄连治疗溃疡性结肠炎的作用机制.方法 利用TCMSP和UniProt数据库获取黄连活性成分及其对应靶点,经GeneCards、OMIM、Drugbank、TTD、DisGeNET数据库筛选溃疡性结肠炎相关靶点,利用Venny 2.1.0 获取黄连和溃疡性结肠炎的交集靶点,并上传String 11.0 数据库绘制蛋白相互作用(PPI)网络图.通过Cytoscape3.9.0 的Cyto Hubb 插件和"药物活性成分-靶点-通路网络图"筛选核心靶点.借助Metascape 数据库对交集靶点进行基因本体功能注释(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.通过Autodock Tools 1.5.6 软件将活性成分与核心靶点进行分子对接.用分子动力学模拟法验证最佳结合模型的稳定性.结果 共筛选出黄连 7 个活性成分及其 137 个靶点,溃疡性结肠炎 1 258 个相关靶点和 81 个交集靶点.核心靶点包括蛋白激酶B1(Akt1)、B淋巴细胞 2(BCL2)、有丝分裂原活化蛋白激酶 1(MAPK1)等.生物过程包括无机物的反应、细胞因子受体结合等.KEGG通路富集主要包括MAPK信号通路等.分子对接结果显示,黄连的核心活性成分能够很好地与关键靶点结合.MD进一步验证了能量结合最好的小檗碱与白细胞介素(IL)-1β的结合能为-36.19 kJ/mol.结论 黄连可能通过多成分、多靶点及多通路参与溃疡性结肠炎的治疗.

关键词：黄连、溃疡性结肠炎、网络药理学、分子对接、分子动力学、作用机制、槲皮素、小檗碱、(R)-氢化小檗碱、木兰花碱

所属期刊栏目：38

分类号：R285(中药学)

资助基金：云南省科技厅科技计划项目;昆明市卫生健康委员会卫生科研课题项目;昆明市卫生科技人才培养项目

在线出版日期：2023-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2444-2450