基于网络药理学联合加权基因共表达网络分析黄精治疗代谢性相关脂肪性肝病的作用机制

摘要：

目的 运用网络药理学结合加权基因共表达网络分析(WGCNA)探究黄精治疗代谢性相关脂肪性肝病的作用机制.方法 利用中药系统药理数据分析平台(TCMSP)检索黄精主要活性成分,并采用Pharm Mapper平台挖掘黄精活性成分相关靶点.在GeneCards数据库中下载并整理了代谢性相关脂肪性肝病相关基因.通过GEO平台下载代谢性相关脂肪性肝病相关基因芯片GSE89632,使用R软件limma包进行差异分析,并运用WGCNA筛选出的模块基因作为疾病靶点基因.R软件Venn Diagram包进行交集分析并可视化.采用R软件clusterProfiler包对交集靶点基因进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.采用Cytoscape软件进行"药物-活性成分-共同靶点"网络的构建与分析.将交集靶点基因上传至String数据库,把结果数据导入至Cytoscape软件构建蛋白相互作用(PPI)网络并筛选核心靶点基因.采用MOE软件进行分子对接.结果 共筛选出黄精活性成分 12 个,成分相关靶点 327 个;GeneCards数据库整理获得代谢性相关脂肪性肝病相关基因 1 227 个;WGCNA关联模块基因 2 639 个;最终获得黄精治疗代谢性相关脂肪性肝病靶点基因 18 个.富集分析发现 18 个靶点基因通过调控胰岛素抵抗、脂质和动脉粥样硬化、代谢性相关脂肪性肝病等信号通络,参与细胞间信号传导、脂质代谢、氧化应激、炎症反应等生物过程.分子对接研究显示核心靶点与相关黄精活性成分结合稳定.结论 黄精具有治疗代谢性相关脂肪性肝病的作用,且在治疗代谢性相关脂肪性肝病中具有多靶点、多成分、协同作用的特点.

关键词：黄精、代谢性相关脂肪性肝病、加权基因共表达网络分析、网络药理学、β-谷甾醇、无梗五加苷B

所属期刊栏目：38

分类号：R285;R975(中药学)

资助基金：国家自然科学基金;陕西省重点研发计划项目;陕西省教育厅科研项目;国家级大学生创新创业训练计划项目

在线出版日期：2023-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1606-1614