GEO芯片联合网络药理学和分子对接探讨归芍地黄汤治疗新生血管性年龄相关性黄斑变性的作用机制及实验验证

摘要：

目的 基于高通量基因表达数据库(GEO)、网络药理学和分子对接技术分析归芍地黄汤对新生血管性年龄相关性黄斑变性的可能作用靶点和相关机制,并通过体内实验进行验证.方法 通过查阅文献及中国传统医学公共数据库(TCMSP)确定归芍地黄汤的主要成分及靶标,绘制成分-靶点网络拓扑图.通过整合GEO数据库和公共数据库对新生血管性年龄相关性黄斑变性的疾病靶点进行预测.使用Venny在线平台确定药物-疾病的交集靶点,构建蛋白质相互作用(PPI)网络图,利用Cytoscape软件筛选关键基因(Hub),利用R语言对交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.将归芍地黄汤核心成分与靶基因之间进行分子对接,最后利用光学相干断层扫描和免疫组化显示组织病理学变化,荧光素眼底血管造影观察脉络膜新生血管膜渗漏情况,并验证其对靶基因表达水平的影响.结果 从GSE29801 数据集中获得 50 个差异基因,筛选得到药物-疾病交集靶点 134 个.核心靶点包括白蛋白(ALB)、肿瘤蛋白p53(TP53)、蛋白激酶B1(Akt1)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(CASP3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、过氧化氢酶(CAT)、表皮生长因子受体(EGFR)、缺氧诱导因子 1A(HIF1A).这些基因主要富集在对外来生物刺激的反应、对营养水平的反应和创口愈合等生物学过程中,参与衰老、氧化应激、免疫炎症反应和细胞凋亡等相关途径.分子对接预测显示,归芍地黄汤核心成分与丝裂原活化蛋白激酶 8(MAPK8)、VEGFA、TNF-α、IL-6 表现出稳定的结合.动物实验显示,归芍地黄汤减轻了激光造模诱导的眼底病变,下调了 VEGF、TNF-α 水平,且治疗前后 BN 大鼠 p38 MAPK 表达水平存在差异.结论 归芍地黄汤可以减轻脉络膜新生血管膜渗漏大鼠视网膜病变,揭示了归芍地黄汤治疗新生血管性年龄相关性黄斑变性可能与激活MAPK信号通路有关.

关键词：归芍地黄汤、新生血管性年龄相关性黄斑变性、GEO数据库、网络药理学、山柰酚、槲皮素

所属期刊栏目：38

分类号：R285(中药学)

资助基金：福建省自然科学基金资助项目;福建中医药大学附属人民医院中药制剂研发项目

在线出版日期：2023-06-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共14页

页码：1321-1334