10.7501/j.issn.1674-5515.2023.03.007
基于网络药理学和分子对接技术探讨蛇床子治疗湿疹的作用机制
目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨蛇床子治疗湿疹的可能作用靶点及机制.方法 采用口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18为阈值,在TCMSP和SwissTargetPrediction平台筛选蛇床子的主要化学成分及其作用靶点;以"eczema"为关键词,借助GeneCards、DisGeNET数据库获取与湿疹相关的疾病靶点;Venny 2.1.0获取蛇床子组分靶点与湿疹的共有靶点;采用Cytoscape 3.9.0软件构建"蛇床子-化学成分-作用靶点"网络图,并根据网络图中度(degree)值,筛选出蛇床子治疗湿疹的核心活性成分;利用STRING数据库及Cytoscape 3.9.0软件构建交集靶点的蛋白相互作用(PPI)网络图并筛选核心靶点;基于Omicshare云平台对交集靶点的基因本体论(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,预测蛇床子治疗湿疹的潜在作用通路,最后通过分子对接技术验证活性成分与核心靶点的结合能力.结果 筛选出蛇床子化学成分20个,化学成分靶点与湿疹疾病共同靶点33个."蛇床子-化学成分-共有靶点-湿疹"网络图筛选核心化合物3个,分别为香叶木素、花椒油素N、6-香叶基-7-羟基香豆素.PPI网络拓扑分析和KEGG通路富集分析发现蛇床子可通过作用于肿瘤坏死因子(TNF)信号通路及蛋白激酶B1(AKT1)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、磷脂酰肌醇3-激酶调节亚基1(PIK3R1)、血管细胞黏附分子1(VCAM1)、胞间黏附分子-1(ICAM1)、磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚基α(PIK3CA)等核心靶点发挥治疗湿疹的作用.分子对接进一步验证主要成分和关键靶点的相互作用,其中香叶木素、花椒油素N、6-香叶基-7-羟基香豆素与核心靶点MMP9、AKT1的对接亲和度较高.结论 网络药理学联用分子对接技术揭示蛇床子可以通过多成分、多靶点、多途径改善湿疹,为其进一步深入研究及临床应用提供新思路与理论依据.
蛇床子、湿疹、网络药理学、分子对接、香叶木素、花椒油素N、6-香叶基-7-羟基香豆素、蛋白激酶B1、基质金属蛋白酶9
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R966(药理学)
国家自然科学基金;中央高校基本科研业务费专项资金资助项目
2023-03-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共7页
540-546