基于肿瘤基因组图谱分析肾透明细胞癌浸润性免疫细胞分布及预后
目的 了解肾透明细胞癌不同分子亚型中浸润性免疫细胞的分布特点,探讨肾透明细胞癌分子亚型与肿瘤预后的关系.方法 采用生物信息学方法,对肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中肾透明细胞癌样本基因表达定量数据进行分析,对获得的肾透明细胞癌分子亚型,应用CIBERSORT软件计算每个肿瘤样本中22种免疫细胞的分布比例,Cox回归模型评估不同肾透明细胞癌分子亚型与总生存期(OS)的关系.结果 验证肾透明细胞癌存在3种亚型.533例肾透明细胞癌肿瘤组织中,M2巨噬细胞(28.33％)、未活化CD4+记忆性T胞(18.05％)、CD8 T细胞(l0.05％)、M1巨噬细胞(6.91％)、单核细胞(4.14％)、未活化的肥大细胞(3.86％)、调节性T细胞(3.01％)、滤泡辅助性T细胞(2.83％)及未活化的自然杀伤细胞(2.67％)分布较为丰富.肾透明细胞癌亚型2(4.26％)与亚型3(3.97％)中的调节性T细胞分布比例均显著高于亚型1(1.92％);亚型2(5.79％)与亚型3(5.88％)中的M1巨噬细胞分布比例显著低于亚型1(8.16％);亚型1中的未活化肥大细胞分布比例(5.48％)显著高于亚型2(2.48％)与亚型3(3.45％),以上差异均有统计学意义(均P＜ 0.001).Kaplan-Meier生存曲线及COX回归分析均发现亚型1组患者总生存期相对较长,且预后相对较好;亚型2组患者总生存期最短,且预后也较差;亚型3组患者总生存期介于亚型1组与亚型2组之间.结论 不同肾透明细胞癌分子亚型中,浸润性免疫细胞分布比例差异显著,肾透明细胞癌分子分型与患者预后明显相关.
肾透明细胞癌、肿瘤浸润免疫细胞、预后
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R737(肿瘤学)
上海市科学技术委员会医学引导项目134119a2801
2019-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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