基于生物信息学分析斑秃的免疫浸润机制及中药治疗靶点预测

摘要：

目的:筛选出斑秃的差异表达基因(differentially expressed gene ，DEGs)，探究其免疫浸润机制并预测中药治疗靶点，为斑秃的发病机制和中医治疗探究提供新的思路。方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载斑秃相关基因芯片表达谱；筛选DEGs并进行富集分析；基于String数据库构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction，PPI)，并通过Cytoscape软件筛选关键基因；通过CIBERSORT反卷积法分析免疫细胞浸润相关性；利用医学本体信息检索平台Coremine medical数据库筛选关键基因对应的中药靶点。结果:在3个斑秃芯片样本中共筛选出164个DEGs。GO富集分析显示这164个DEGs主要富集在皮肤发育、分子活性、内肽酶抑制物活性、超分子纤维等方面；KEGG富集分析筛选出金黄色葡萄球菌感染、雌激素信号通路、Wnt信号通路、转化生长因子β(TGF-β)等信号通路。通过PPI分析共筛选出
KRT85、BMP2、KRTAP3-1、KRT27、MSX2、KRTAP11-1、HOXC13、DSG4、KRT82、TCHH这10个关键基因。DEGs与免疫浸润细胞相关性分析结果显示，γδT细胞(
P<0.001)、M1巨噬细胞(
P<0.001)等差异具有统计学意义。通过Coremine medical数据库映射出黄芪(
P＝0.0178)、鳖甲(
P＝0.0012)、降香(
P＝0.0033)等潜在中药靶点。
结论:本研究利用生物信息学方法筛选斑秃发病相关候选基因，表明其与免疫浸润细胞密切相关，并筛选出了潜在的中药治疗靶点，为深入研究斑秃病理学机制和治疗方法提供了理论依据。

关键词：斑秃、生物信息学、差异表达基因、免疫浸润、中药治疗

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资助基金：国家自然科学基金81773312;广东省"扬帆计划引进紧缺拔尖"人才项目201433005;东莞市社会发展重点项目20211800905552;National Natural Science Foundation of China81773312;Guangdong Province "Sailing Plan to introduce top-notch talents"201433005;Key social development project of Dongguan City20211800905552

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：429-440