食管鳞癌中神经纤毛蛋白2基因断裂和重排的分析与鉴定

摘要：

目的：分析食管鳞癌中的基因断裂及重排，旨在为食管鳞癌的诊断及治疗提供分子标志和新的治疗靶点。方法通过对食管鳞癌手术标本进行单核苷酸多态性（ single nucleotide polymorphism ， SNP ）微阵列检测，首先发现基因内部断裂；采用 cDNA 末端快速扩增法（ rapid amplification of cDNA ends ， RACE ）技术鉴定与断裂基因残留部分融合的新的染色体片段，采用蛋白免疫印迹（ Western blotting ）和免疫组织化学（ immunohistochemistry ， IHC ）方法检测基因断裂后的表达情况；利用荧光原位杂交（ fluorescence in situ hybridization ， FISH ）技术检测候选基因在较大临床样本中的断裂频率。结果 SNP 微阵列分析6例食管鳞癌手术组织，在2例标本中发现2号染色体长臂33.3区段的 NRP 2基因内发生了断裂。3′-RACE 分析结果表明，在其中1例的互补 DNA 水平存在神经纤毛蛋白2-膜联蛋白 A 13基因（ NRP 2-ANXA 13）融合转录本。通过 FISH 进一步分析16例食管鳞癌组织，发现6例存在NRP 2断裂，其中2例疑似存在 NRP 2-ANXA 13重排。 Western 印迹和 IHC 分析结果显示，发生 NRP 2-ANXA 13融合病例标本的正常 NRP 2蛋白表达与癌旁组织相比显著下调。结论在食管鳞癌组织中存在 NRP 2基因的高频断裂和 NRP 2-ANXA 13的基因融合，该结果为探明食管鳞癌中基因断裂和重排的作用及机制提供了新的重要线索。

关键词：NRP2、基因断裂、基因融合

所属期刊栏目：39

分类号：S85;R73

资助基金：国家自然科学基金81330052、81321091

在线出版日期：2016-12-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：233-239