10.16780/j.cnki.sjssgncj.20220089
双相情感障碍与抑郁症DLPFC脑区转录组差异基因表达数据挖掘分析
目的:基于数据挖掘分析双相情感障碍(BD)与抑郁症背外侧前额叶皮质(DLPFC)转录组差异性分子表达,分析两者差异性基因相关通路及其与免疫、代谢的关系.方法:以"bipolar disorder"、"depression"、"sequencing"为关键词,在GEO数据库检索.从该基因库中分别提取6例对照和7例BD患者、29例对照和30例抑郁症患者的DLPFC转录组数据;240例健康对照和240例BD患者的外周血转录组数据,利用DE-Seq2软件计算差异表达基因,基于生物学过程(BP)采用GO功能分析、差异分析、交集分析的方法,分析2种疾病差异性基因相关通路及其与免疫、代谢的关系.结果:BD患者DLPFC脑区显著高表达基因总共有384个,显著低表达基因总共有117个.抑郁症患者DLPFC脑区显著高表达基因总共有165个,显著低表达基因总共有316个.BD患者和抑郁患者的脑区与正常对照相比都会发生神经系统的异常,而抑郁多富集免疫炎症相关通路,BD多富集在代谢相关通路.基因交集结果显示,抑郁患者差异基因中有74个免疫相关基因和20个代谢相关基因;而BD患者差异基因中有42个免疫相关基因和51个代谢相关基因.BD患者DLPFC脑区、外周血存在着51个与代谢相关差异性基因,外周血转录组数据验证代谢通路富集结果显示脂肪酸生物合成、泛醌等萜醌生物合成、硒化合物代谢、其他聚糖降解、其他类型的O.聚糖生物合成异常.结论:DLPFC转录组结果提示2种精神疾病在免疫、代谢相关功能的基因中发生异常比例不同,抑郁容易出现免疫相关异常,BD更容易出现代谢相关基因异常.
双相情感障碍、抑郁症、数据挖掘、背外侧前额叶皮质、代谢
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R741;R749(神经病学与精神病学)
湖南省卫生计生委科研课题;湖南省卫生计生委科研课题;湖南省临床医学研究中心;湖南省重点研发项目
2023-02-13(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共5页
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