10.11817/j.issn.2095-6959.2024.230426
肾透明细胞癌线粒体相关lncRNA预后模型的建立
目的:近年来对肾透明细胞癌(clear cell carcinoma of kidney,KIRC)的研究进展显著,但该疾病的预后较差,特别是在肿瘤转移的情况下.因此,寻找有效的预后指标和治疗靶点对提高KIRC患者的生存率和生活质量至关重要.本研究旨在探讨线粒体相关长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在KIRC中的预后作用,并建立一个预后模型.方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中获取KIRC的RNA测序和临床数据,并从MitoCarta3.0数据库中提取线粒体基因列表.计算每个lncRNA与线粒体基因的相关系数,并筛选出显著相关的lncRNA.采用R软件的Cox回归分析结合Kaplan-Meier法筛选与KIRC预后相关的lncRNA.构建预后模型,根据模型计算每个样本的风险评分,并根据评分将其分为高风险组和低风险组,进而比较2组的生存期,利用受试者操作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线评估模型的预测能力,再使用Cox回归分析风险评分与患者临床特征的相关性.结果:相关系数筛选出31个与KIRC线粒体相关的lncRNA.Cox回归分析和Kaplan-Meier法筛选确定了6个与KIRC预后高度相关的lncRNA,并构建了其预后模型.该模型的ROC曲线下面积为0.723,表明该模型具有良好的预测能力.另外,风险评分与患者年龄、肿瘤分级、病理分期及T分期呈正相关,多因素Cox分析结果显示风险评分为KIRC的独立预后预测因子.结论:本研究建立的基于线粒体相关lncRNA的预后模型为KIRC患者提供了一个预后评估工具,这将有助于指导KIRC的个体化治疗和预后评估.
肾透明细胞癌、线粒体、长非编码RNA、预后、模型
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R735.2;R687.3;R573
2024-08-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共9页
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