10.3978/j.issn.2095-6959.2015.06.S041
应用DNA甲基化芯片对胃癌及其癌旁组织基因组甲基化的分析
目的:应用DNA甲基化芯片检测胃癌及其癌旁组织基因组甲基化情况,并进行功能分析。方法:采用甲基化DNA免疫沉淀方法(MethylatedD NAimmunoprecipitation,MeDIP)结合NibleGen公司DNA甲基化芯片对胃癌及其癌旁组织进行甲基化情况分析。结果:位于基因启动子区,存在于胃癌组织中的甲基化差异基因为113个,如SHP1、FGF8、CSF2RA;存在于癌旁组织甲基化差异基因为161个,如:TNF、IGF2、BMP7。位于CpG岛,存在于胃癌组织中的甲基化差异基因为123个。如:WNT2B、JAK2、TPT1;存在于癌旁组织甲基化差异基因为139个,如:TNFRSF4、HOXC8、NFYA。这些基因位于不同的染色体上,胃癌组织中以1号和4号染色体甲基化差异基因最多,均为11个。18号和20号染色体甲基化差异基因最少,均为1个;癌旁组织中以9号、19号和20号染色体甲基化差异基因最多,均为11个, Y染色体甲基化差异基因最少,为0个。结论:胃癌组织及其癌旁组织基因组DNA甲基化情况存在显著差异。DNA甲基化基因分布在不同染色体上,其个数和分布差异很大,CCDC6、FGF8、CSF2RA、WNT2、PRKAR2A、TNF、PRKACA、BMP7、SHP1、JAK2等基因与多条肿瘤相关通路有关。
应用、基因组甲基化、芯片检测、胃癌组织、癌旁组织、差异基因、染色体、肿瘤相关、启动子区、基因分布、功能分析、分布差异、沉淀方法、通路、免疫
R73;R28
2015-09-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共2页
44-45