肺癌全基因组测序

摘要：

肺癌是全球肿瘤发病率和病死率的主因，且预后很差。加强对肿瘤生物学的认识对肺癌研究至关重要。被誉为“下一代测序技术”的NGS技术（next-generation sequencing）是一种针对全基因组鉴定的有力工具，可以对致癌体细胞突变进行全面检测。大多数的NGS技术是基于平台特异性DNA文库进行多重聚合酶链反应（polymerase chain reaction，PCR），从而对目的基因扩增后测序。这种技术适用于高通量测序，可以检测出肿瘤中出现的全部基因组变异。缺点是这种技术需要在时间、实验设备、计算机数据分析、生物信息技术等各方面的大量投入。NGS技术已广泛应用于全基因组、外显子组、转录组和表观基因组的研究中，为肺癌研究和医疗模式带来改变。这项新技术的开展将转变当前对致癌信号通路的认识，可为癌症诊疗提供新的分子靶点。肺癌体细胞突变已有NGS技术的分析报道，但大规模基因组研究仍在进行中。个体化治疗策略将改善那些潜在获益患者的治疗方式，避免“无辜”患者受无效治疗带来的高额费用和不良反应。NGS的组织化、计算机化和生物信息化技术推动了科技的进步，同时，患者知情权和数据发布的相关伦理问题也浮现出来。信号通路中，驱动基因（driver gene）突变和传递基因（passenger gene）突变的区别，需要对测序结果进行细致解读。解读准确与否取决于DNA提取的样本类型、样本处理技术和样本含量。肿瘤异质性也会降低肿瘤基因突变的检测效能。NGS技术将推动对肿瘤基因突变的基础和临床研究，而且，也可应用于单细胞和游离的循环DNA，未来还将用于从体液和肿瘤亚群中获取的DNA样本。如果能进一步降低费用、提高检验速度和精度，NGS技术无疑将会成为肺癌研究的绝佳选择。

关键词：高通量核苷酸测序、DNA序列分析、肺肿瘤、非小细胞肺癌、小细胞肺癌

分类号：U49;TQ

资助基金：国家卫生与医学研究联合会NRMHC项目KF；NHMRC医师研究基金KF；NHMRC职业发展基金IY；NHMRC医学奖学金CW；昆士兰癌症协会博士奖学金MD；昆士兰癌症协会高级研究奖学金KF；昆士兰癌症协会项目；昆士兰智慧之州项目；卫生与医疗研究办公室OHMR项目；查尔斯王子医院基金会，澳大利亚胸肺基金会/勃林格殷格翰COP;UQ年轻科研人员基金VR。hTis work was supported by National Health and Medical Research Council NRMHC project grants;NHMRC Practitioner Fel owship;NHMRC Career Development Fel owship;NHMRC Biomedical Scholarship;Cancer Council Queensland PhD Scholarship;Cancer Council Queensland Senior Research Fel owship;Cancer Council Queensland project grants;Queensland Smart State project grants;O?ce of Health and Medical Research OHMR project grants;hTe Prince Charles Hospital Foundation, Australian Lung Foundation/Boehringer Ingelheim COPD Research Fel owship;NHMRC Postgraduate Medical Scholarship;University of Queensland UQ PhD Scholarship;UQ Early Career Researcher Fel owship;Australia

在线出版日期：2013-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：277-285