基于5种基因甲基化差异构建肾透明细胞癌预后分子标签

摘要：

目的:鉴定肾透明细胞癌(ccRCC)甲基化生物标志物，并构建ccRCC甲基化预后分子标签。方法:提取TCGA数据库中ccRCC患者的临床数据以及ccRCC甲基化数据，筛选出ccRCC癌组织和正常肾组织中甲基化差异基因，然后将差异基因经过LASSO-Cox回归分析筛选ccRCC预后相关的基因并构建ccRCC预后分子标签。结果:首先筛选出485例ccRCC癌组织和正常肾组织中甲基化差异基因798种，差异基因结合ccRCC生存数据经过单因素Cox分析得到492种与ccRCC预后相关的甲基化差异基因(
P<0.05)；再将325例肿瘤组织样品数据按30%和70%随机分为两组，70%组为训练组用于筛选预后分子标签，30%组为测试组用于测试筛选出的分子标签预测预后效果。采用LASSO-Cox回归分析从中筛选出5种与ccRCC预后相关的甲基化差异基因，分别为CMTM3、HAND2、HIST1H3E、MIR4425、SHOX2。利用5种基因联合多因素COX回归系数构建分子标签：-5.36342273779505×DML
CMTM3+3.260844271×DML
HAND2+4.995985347×DML
HIST1H3E-1.84339230384795×DML
MIR4425+3.323857473×DML
SHOX2代入相关数据后，计算分子标签分值。训练组、测试组、全部数据组的分子标签值与ccRCC患者生存期显著相关，分子标签值越高患者预后越差。
结论:通过对TCGA数据库的挖掘，发现影响ccRCC预后的有5种基因，且联合5种基因构建的分子标签与ccRCC患者的预后有显著性关联，构建的ccRCC预后模型有望应用于临床。

关键词：癌，肾细胞、DNA甲基化、预后生物标志物

所属期刊栏目：41

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：989-992