刚地弓形虫抑制蛋白主要特性分析与抗原表位预测

摘要：

目的 用生物信息学方法分析刚地弓形虫抑制蛋白(T.gondii profilin,TgPRF)的主要特性与抗原表位,筛选该蛋白的T/B细胞联合抗原表位. 方法 利用NCBI上的ORF finder、ProtParam、SignalP、TMHMM、Motif Scan、WoLF PSORT、PSORTⅡ、SOPMA、Bcepred、SYFPEITHI、NetCTL等生物信息学在线分析程序,结合Gene Runner和DNAMAN等生物信息学软件,分析并预测TgPRF蛋白的开放阅读框、理化性质、信号肽、跨膜区、翻译后修饰位点、亚细胞定位、二级结构、表面可及性、可塑性、亲(疏)水性及T/B细胞抗原表位. 结果 TgPRF基因的开放式阅读框为492个碱基的核苷酸序列.TgPRF蛋白由163个氨基酸组成,相对分子质量为17 555.2,分子式为C764H1160N204O258S7,等电点为4.40,有4个表面可及性参数≥1.9的区域、5个亲水性参数得分≥1.9的区域、3个柔韧性参数得分≥2的区域、10个翻译后修饰位点、8个潜在B细胞抗原表位和3个T/B细胞联合表位. 结论 TgPRF蛋白有多个优势抗原表位,为后续弓形虫免疫保护性的研究提供理论指导.

关键词：刚地弓形虫、抑制蛋白、生物信息学、抗原表位

所属期刊栏目：42

分类号：R392.11;S855.3;Q786

在线出版日期：2016-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：352-355