MassARRAY核酸质谱在结核分枝杆菌检测中的应用价值

摘要：

目的:探讨MassARRAY核酸质谱在结核分枝杆菌(MTB)检测中的应用价值。方法:采用MassARRAY检测参考菌株MTB特定基因IS6110和ext-rd9，测定MassARRAY的最低检出限。本研究为诊断性研究。采用非随机抽样法，收集西安市胸科医院2022年9月至12月疑似结核病患者呼吸道标本和其他体液或组织标本，收集经抗酸染色阳性而分枝杆菌菌种鉴定排除MTB的培养阳性物。对患者样本采用MGIT960液体培养法(简称培养法)、实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)法、Gene Xpert/RIF和MassARRAY检测MTB，比较各方法阳性率。以Gene Xpert/RIF为标准，对比各方法敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、符合率、Kappa值和受试者工作特征(ROC)曲线下面积。将等量的H37Rv分别与金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌和肺炎链球菌混合，采用MassARRAY法检测MTB。对经抗酸染色阳性而分枝杆菌菌种鉴定排除MTB的84例培养阳性物进行qPCR和MassARRAY检测。结果:共收集肺源性标本126例，肺外标本92例。MassARRAY检测IS6110基因的最低检出限为10 CFU/ml，检测ext-rd9基因的最低检出限为10~10
3 CFU/ml。在218例临床标本中，MassARRAY法阳性率高于qPCR法和Xpert法，在肺源标本和肺外标本中，以及培养阳性标本和培养阴性标本中，MassARRAY法阳性率均分别高于qPCR法和Xpert法。在肺源标本中，以Xpert为标准，MassARRAY法检测MTB敏感度(98.39%)、阴性预测值(98.28%)、符合率(93.65%)和一致性(0.873)高于qPCR法和培养法，一致性与Xpert法几乎一致，其ROC曲线下面积(0.937)高于qPCR法和培养法。在肺外标本中，以Xpert为标准，MassARRAY法检测MTB敏感度(83.78%)和阴性预测值(88.00%)高于qPCR法和培养法，符合率(81.52%)高于培养法，一致性(0.624)高于培养法，与Xpert法高度一致，其ROC曲线下面积(0.819)高于培养法。H37Rv与细菌混合后，各组均可检出IS6110和ext-rd9基因。与单独H37Rv组相比，混合细菌组IS6110和ext-rd9基因检出峰值差异无统计学意义。在84株抗酸染色阳性分离菌株中，有4例堪萨斯分枝杆菌和1例巴西诺卡菌中检测到了IS6110基因。
结论:MassARRAY核酸质谱具有灵敏、准确等特点，适合对结核病患者进行早期、快速诊断，在结核病诊断中具有良好的应用前景。

关键词：MassARRAY、质谱、结核分枝杆菌、IS6110

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在线出版日期：2024-01-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1149-1156