基于移植后闭塞性细支气管炎间充质干细胞芯片数据的生物信息学分析

摘要：

目的 应用生物信息学方法研究闭塞性细支气管炎移植物中间充质干细胞与肺源性间充质干细胞的差异基因表达.方法 从基因表达数据库(GEO)在线数据库中下载并分析获得的闭塞性细支气管炎和胎肺肺组织中间充质干细胞明显表达差异的233个基因.对差异基因进行功能富集并分析蛋白质与蛋白质间相互作用关系.结果 共筛选出233个差异基因,其中上调基因142个,下调基因91个.利用DAVID数据库对差异基因进行GO和KEGG Pathway分析显示,差异基因主要富集于磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、酪氨酸磷酸化正性调节、淋巴管生成的正性调节、生长因子活性、金属肽酶活性等相关.将差异基因进行蛋白质相互作用分析后筛选出网络的核心基因主要为COL1A1、FGF2、ASNS、PHGDH、COL3A1、INHBE,核心基因之间存在复杂的相互作用.结论 肺源性与移植后闭塞性细支气管炎移植物中间充质干细胞差异基因的相互作用可能与移植后闭塞性细支气管炎的发生有关,为进一步基础研究提供实验靶点.

关键词：细支气管炎、闭塞性、基因表达、计算生物学、间充质干细胞

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资助基金：国家自然科学基金81770063;广东省社会发展领域科技计划项目2014A020212356;广州市科技创新项目201504281719217;呼吸疾病国家重点实验室开放课题SKLRD20160P005National Natural Science Foundation of China81770063;Science and Technology Planning Project of Guangdong Province of China2014A020212356;Innovation Project of Guangzhou201504281719217;National Key Laboratory of Respiratory DiseasesSKLRD20160P005

在线出版日期：2019-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1121-1126