基于靶基因文库的高通量测序平台建立肥厚型心肌病患者致病基因突变检测方法

摘要：

目的 基于靶基因文库,应用下一代半导体高通量测序平台,建立快速、 准确的肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)常见致病基因突变检测方法 ,有利于HCM患者的早期预防及临床分子诊断.方法 选择国内外公认的与HCM致病相关的常见基因(MYH7、MYBPC3、TNNT2、TNNI3、ACTC1、PRKAG2、MYL2和MYL3),应用Primer5及Primerselect引物设计软件对靶基因编码区进行引物设计.基于下一代半导体高通量测序平台,对2019年3月至8月在大理大学第一附属医院采集的4例HCM患者外周静脉血液标本,提取基因组,构建靶基因文库,进行上机测序,测序质量评估及变异位点注释.最后对注释分析得到的与HCM致病相关的突变位点进行Sanger测序验证.结果 通过建立的高通量测序方法 ,检出了4个与HCM致病相关的突变位点MYBPC3-c.478 C>T、MYH7-c.161 G>A、TNNI3-c.370 G>C和MYL3-c.377 A>G,并通过金标准的Sanger测序验证,结果 完全一致.结论 基于靶基因文库及高通量测序平台建立的HCM患者常见致病基因突变检测方法 ,能为临床分子诊断实验室工作者开展遗传基因突变检测提供参考.

关键词：高通量测序技术、靶基因文库、肥厚型心肌病、致病基因、检测方法

所属期刊栏目：18

分类号：Q39;Q3-3(人类遗传学)

资助基金：云南省应用基础研究计划-面上项目 ;云南省教育厅科学研究基金项目 ;大理大学人才培养基金项目 ;和大理大学代谢性疾病创新团队

在线出版日期：2021-03-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

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