免疫相关基因预后模型的构建对喉癌患者预后的影响

摘要：

目的:探讨基于生物信息学方法构建免疫相关基因（immune-related genes，IRG）预后模型以准确预测喉癌患者的预后。方法:从癌症基因组图谱（the Cancer Genome Atlas，TCGA）数据库获得111个喉癌组织和12个正常相邻组织之间的差异表达基因（differentially expressed genes，DEG）。利用ImmPort数据库识别出差异表达的IRG。Cox单变量生存分析用于筛选与生存相关的IRG。差异表达的与生存相关的IRG被认为是预后相关的免疫基因。然后构建免疫基因预后模型计算患者风险值，受试者ROC曲线分析验证模型准确性。通过该模型行单因素、多因素独立预后分析证明其独立预测能力。最后分析关键免疫基因与临床病理参数的关联。结果:鉴定喉癌的DEG并筛选出IRG。接着与预后生存时间结合，鉴定8个关键免疫基因（CXCL11、RBP1、AQP9、CYSLTR2、BTC、STC2、UCN和FCGR3B）作为免疫基因预后模型，这种预后模型可以准确的将患者分为高危和低危人群。总体生存分析表明，高危患者的生存时间比低危患者要短（
P<0.0001）。模型的ROC曲线下面积为0.810，提示预后模型具有较高的敏感性和准确性。单因素和多因素Cox回归表明其为喉癌患者预后的独立预测因素。此外，我们发现模型中的5个关键基因与临床病理特征显著相关。
结论:基于生物信息学方法构建喉癌的免疫相关基因预后模型，发现8个基因有助于预测喉癌患者的预后，其中5个与临床病理特征显著相关。

关键词：喉肿瘤、肿瘤微环境、预后、免疫相关基因、预后模型

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资助基金：苏州市科技局项目SLT202007;苏州市科技局项目SS201861;苏州市科技局项目SYS2018040;Science and Technology Bureau of SuzhouSS201861;Science and Technology Bureau of SuzhouSLT202007;the Science and Technology Bureau of SuzhouSYS2018040

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

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