北京两株HIV-1独特重组型CRF55_01B/CRF07_BC近全长基因组遗传特征分析

摘要：

目的:对北京治疗前耐药监测发现的具有遗传相似性的两株新发重组毒株进行前病毒HIV-1 DNA近全长基因组扩增和序列分析，以了解其遗传特征和重组模式。方法:对北京佑安医院募集的2例新发重组毒株感染者，用广州海力特公司核酸提取和纯化试剂从白细胞富集层提取前病毒HIV-1 DNA。运用SimPlot 3.5软件分析重组模式和断点，并用Mega 11构建分片段最大似然法进化树验证重组事件。结果:从2个男男性行为（men who have sex with men，MSM）感染者扩增获得HIV-1近全长基因组序列。SimPlot重组断点分析显示BL6218-00和BL6017-01基因组均以CRF55_01B为骨架，分别在
gag和
env基因区，或
gag、pol、vpu/env、nef/3’LTR基因区，由CRF07_BC重组而成。2条序列的CRF07_BC片段均与来自MSM人群的CRF07_BC_N参考毒株序列聚集成单系进化簇。
结论:用前病毒DNA扩增方法从北京MSM人群发现了两株以CRF55_01B为骨架且重组模式不同的独特重组型毒株，重组亲本CRF07_BC均来自我国北方MSM人群。

关键词：独特重组型、近全长基因组、前病毒DNA、系统进化

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资助基金：首都卫生发展科研专项2022-1G-3015;北京市自然科学基金7202074;Capital's Funds for Health Improvement and Research2022-1G-3015;Beijing Natural Science Foundation7202074

在线出版日期：2024-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：280-284