10.3760/cma.j.issn.1673-4092.2020.02.004
诺如病毒GI.6[P11]与GII.13[P16]共感染的分子特征分析
目的:在同一个标本中检测出了两种组别的诺如病毒,对这两个诺如病毒的分子特征进行初步分析。方法:利用普通RT-PCR对两个病毒的部分聚合酶区及衣壳蛋白区片段进行扩增和序列测定。通过BioEdit软件进行序列比对分析,采用MEGA软件及BEAST软件分别构建进化树进行进化分析,Simplot软件进行重组位点分析。结果:序列进化分析显示标本中确实存在两种不同型别且不同组别的诺如病毒,分别为GI.6[P11]型与GII.13[P16]型;时间进化分析显示GI.P11位于2013—2018分支,GII.13位于GII.13[P16]的2013—2018分支,平均替换速率分别为1.6×10
-3及1.9×10
-3替换/位点/年;GII.13[P16]可能的重组位点在病毒的开放读码框架1上。
结论:本研究对少见的共感染的两种型别重组诺如病毒进行了初步分析,为同种型别的深入研究提供了基础参考数据。
诺如病毒、重组、GI.6[P11]、GII.13[P16]
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南京市医学科技发展项目YKK17183;Key Project Supported by Medical Science and Technology evelopment Foundation, Nanjing Department of HealthYKK17183
2023-05-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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