应用宏基因组测序对贝类中病毒谱的初步分析

摘要：

目的:通过病毒宏基因组学方法分析我国北京市销售的海产品贝类所携带的病毒谱情况。方法:收集北京市销售的330份贝类样本，经过蛋白酶K结合PEG沉淀处理贝类消化腺和肠道后，利用高通量测序和病毒宏基因组进行分析。结果:本研究通过高通量测序后共获得了4 594 270条被注释病毒的基因序列，其中以动物为宿主的病毒序列占21%（965 185/4 594 270）。而在以动物为宿主的病毒序列中，被注释到哺乳动物为宿主的病毒序列占1%（12 205/965 185），包括20个病毒科，包括常见的肠道病毒、甲肝病毒和诺如病毒。诺如病毒基因型包括GII.1、GII.2、GII.13、GII.14和GII.17，GII.2和GII.17诺如病毒基因序列与人间同型流行株的核苷酸相似性分别为100%和98%。结论:北京市销售的不同种贝类中含有多种可以引起人类疾病的病毒病原体序列，有必要开展相应的监测和进一步分析病毒生物活性。

关键词：贝类、宏基因组学、高通量测序、病毒谱

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资助基金：国家科技重大专项2018ZX10734404;国家自然科学基金青年基金81601813;National Key Science and Technology Program of China2018ZX10734404;National Natural Science Foundation of China81601813

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：107-111