2016—2019年北京市GII.2[P16]型诺如病毒全长基因组系统进化分析

摘要：

目的:对2016—2019年北京市GII.2[P16]诺如病毒全长基因组进行系统进化分析。方法:收集2016—2019年北京市GII.2[P16]诺如病毒毒株，采用一步法RT-PCR对基因组全长进行分段扩增，应用BioEdit软件分析核苷酸相似性和氨基酸变异情况，采用BEAST软件分别构建衣壳蛋白（major capsid protein，VP1）区和RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase，RdRp）区全长序列的贝叶斯进化树，结合流行病学资料对毒株进化特征进行分析。结果:测得44个毒株的全基因组序列，其VP1和RdRp基因分型一致。进化分析显示北京市2017年5月以后毒株形成新亚群并分为两个分支，分别以2017—2018年和2018—2019年毒株为主。该亚群毒株在VP1区均存在Val256Ile点突变，但RdRp区没有发现氨基酸变异位点。流行病学数据表明，北京市GII.2[P16]型诺如病毒从2016年10月输入，2017年3月至6月为暴发高峰，2017年7月以后暴发数量明显降低,但2018年底暴发又有所增加。结论:北京市GII.2[P16]诺如病毒新变异株2017年5月之后基因特征有所改变，暴发强度降低，但仍具有传播风险。

关键词：诺如病毒、全基因组、进化分析

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资助基金：北京市预防医学研究中心科研培育专项2019-BJYJ-10;首都卫生发展科研专项2020-2-1001;Research Support Fund of the Beijing Research Center for Preventive Medicine2019-BJYJ-10;Capital's Funds for Health Improvement and Research2020-2-1001

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：97-101