肠道病毒71型感染人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)的miRNA表达谱

摘要：

目的 研究肠道病毒71型(EV71)感染神经细胞的miRNA表达谱,探讨miRNA在病毒感染神经细胞中的可能作用.方法 建立EV71感染人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)模型,收集感染后48 h细胞.以Taqman低密度芯片检测miRNA表达谱,使用实时RT-PCR对芯片结果进行验证并在TargetScan和miRanda网站预测靶基因,采用GO和KEGG分析靶基因功能.结果 成功建立EV71感染SH-SY5Y细胞模型,通过低密度芯片筛选出215种显著升高的miRNA和25种显著下调的miRNA.经过RT-PCR验证,3种miRNA(MiR-10a*、miR-15b*和miR-195)显著下调,7种miRNA(miR-10a、miR-342-5p、miR-483-5p、Let-7b、miR-99a、miR-140-5p和miR-21)显著上调,与芯片结果相符.GO分析显示发展进程和信号调节条目最富集靶基因.KEGG路径分析显示靶基因在肿瘤路径、蛋白水解、Wnt信号传导、黑素形成、粘附连接、MAPK信号通道最富集.结论 EV71感染神经细胞48 h后miRNA表达谱发生改变,10种变化的miRNA靶基因预测在发展进程、信号传导及凋亡中起着重要的作用,可为后期机制研究提供参考.

关键词：肠道病毒71型、miRNA表达谱、人神经母细胞瘤细胞、神经细胞

所属期刊栏目：24

分类号：R73;R97

资助基金：江苏省重大新发传染病综合防控科技示范工程BE2015714;国家自然科学基金81501785;江苏省自然科学基金及"333"人才项目BK20161583

在线出版日期：2017-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：289-295