北京市4例输入性黄热病病例病毒全基因组特征分析

摘要：

目的 通过对2016年北京市4例输入性黄热病病毒全基因组深度测序分析,以期对病毒进行溯源、分析疫苗有效性以及防控策略提供分子依据.方法 将荧光PCR检测为阳性的血液、尿液样本利用Ion Torrent PGM平台进行全基因组深度测序,通过MEGA 6.0软件中邻接法进行遗传进化分析,并采用Lasergene Protean软件进行E蛋白氨基酸变异分析及抗原性分析.结果 从首例病人的血液样本和其他3个病例的尿液样本中分别获得了黄热病病毒的全基因组序列.遗传进化树分析结果表明,4例黄热病病毒基因组与安哥拉71株(AY968064)高度同源,相似度分别达99.21％、98.11％、98.02％、98.39％.4例黄热病病毒E蛋白的氨基酸序列与安哥拉71株的序列分析相似度分别达99.6％、99.39％、99.01％、99.59％.4例黄热病病毒E蛋白抗原性与17D疫苗株(X03700)的E蛋白抗原性比较分析无明差异.结论 4例黄热病病毒都是安哥拉流行株类似株,目前使用的17D疫苗具有有效性.

关键词：黄热病病毒、全基因组测序、遗传进化树分析、氨基酸突变

所属期刊栏目：23

分类号：S852.65;R373.1;S432.41

资助基金：国家自然科学基金81301483

在线出版日期：2017-02-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：368-371