人颗粒溶素蛋白的生物信息学分析

摘要：

目的:预测和分析人颗粒溶素(Granulysin,GNLY)蛋白的结构与功能.方法:采用生物信息学的方法对GNLY迸行系统分析与研究,包括GNLY的理化性质、跨膜区和引导肽、亚细胞定位、二级结构功能域、蛋白质的功能分类预测、多重序列比对与系统发育树构建、三级结构建模等.结果:GNLY蛋白分子量为15.33kD,等电点为9.35,具有引导肽(N端1-22个氨基酸序列)无跨膜区,该蛋白属于分泌性蛋白;其二级结构主要为α螺旋和无规则卷曲,包含1个SapB结构域,三级结构显示结果与二级结构预测结果相符.蛋白质多重序列比对和聚类分析显示,人GNLY蛋白与牛、猪及艾鼬等哺乳动物的GNLY蛋白具有一定的同源性.结论:GNLY生物信息学数据的探索,可为GNLY蛋白的功能研究提供参考资料和理论依据.

关键词：人类、颗粒溶素、蛋白质、结构、生物信息学

所属期刊栏目：36

分类号：Q786(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金81360344;甘肃省人社厅留学回国人员择优资助项目2012123

在线出版日期：2017-12-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：897-902