玉米LEC1基因家族的鉴定与生物信息学分析

摘要：

LEC基因家族包含LEC1和LEC2,参与植物的生长发育及储藏物质的积累.LEC1(Leafy Cotyledon 1)是NF-YB9蛋白家族的成员,编码了CCAAT-box结合转录因子HAP3(Heme activated protein 3)亚单位.利用生物信息学方法,获得了16个玉米LEC1基因.分析发现,ZmLEC1蛋白大部分都是酸性的不稳定亲水蛋白,含有1个保守结构域CBFD_NFYB_HMF及10个保守基序.通过与拟南芥LEC1基因和水稻LEC1基因的聚类分析,将玉米LEC1基因家族分为4类:ClassⅠ、ClassⅡ、ClassⅢ、ClassⅣ.经RNA-seq等分析发现,玉米LEC1家族基因具有组织特异性,响应非生物胁迫.启动子分析发现,玉米LEC1基因启动子上含有响应激素和非生物胁迫的顺式作用元件.

关键词：玉米;LEC1基因家族;生物信息学

所属期刊栏目：53

分类号：S513(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;湖北省高等学校优秀中青年创新团队项目

在线出版日期：2022-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：31-37