石榴MAPK家族基因鉴定及其响应冷胁迫的表达分析
[目的]评价不同石榴种质资源籽粒硬度及抗寒性,筛选可能参与调控石榴抗寒性的MAPK家族基因.[方法]以31份石榴种质资源为试材,进行抗寒性及籽粒硬度评价;基于全基因组筛选石榴MAPK家族基因,对其进行进化、基因结构和蛋白理化性质分析,同时利用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)分析冷胁迫对石榴MAPK家族基因表达模式的影响.[结果]31个石榴品种籽粒硬度及半致死温度测定结果表明,峄城粉红牡丹、淮北六棱甜和鲁白榴2号等硬籽石榴抗寒性较强,华紫、以3和玛丽斯等软籽石榴抗寒性较弱.基于石榴全基因组鉴定出17个MAPK家族基因,广泛分布于8条染色体上;MAPK家族所有成员主要分为3个亚类,其中,A和B亚类成员主要包含PKc_MAPKK_plant_like和PTZ00024结构域,C亚类主要包含PLN00034结构域,所有成员均具有S_TKc结构域;各成员氨基酸残基数量分布在314~860 aa,外显子数目1~18个,蛋白分子质量为34910.05~97965.26 u,等电点4.94~9.35;PgMKK2、PgMPK6、PgMPK9、PgMPK16和PgMPK13在峄城粉红牡丹响应冷胁迫过程中表现为显著上调,PgM-KK8、PgMPK1-1和PgMKK4在玛丽斯响应冷胁迫过程中表现为显著上调;PgMKK2、PgMPK6、PgMPK9、PgMPK16和PgMPK13在峄城粉红牡丹响应冷胁迫过程中的表达量显著高于玛丽斯,PgMKK8和PgMPK1-1在玛丽斯响应冷胁迫过程中的表达量显著性高于峄城粉红牡丹;PgMKK3在峄城粉红牡丹不同时间均未检测到表达,在玛丽斯中表现为先升高后降低的趋势;PgMPK12-2在玛丽斯不同时间均未检测到表达,在峄城粉红牡丹中表现为逐渐升高的趋势.[结论]石榴MAPK家族基因响应冷胁迫信号,其中,PgMKK2、PgMPK6、PgMPK12-2和PgMPK9可能参与正调控石榴的抗寒性.
石榴、籽粒硬度、抗寒性、MAPK、表达分析
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S665.4(果树园艺)
国家重点研发计划;中国农业科学院科技创新工程;河南省科技攻关项目
2023-10-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共13页
2076-2088