基于转录组测序分析NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根糖酵解相关基因的表达

摘要：

[目的]筛选新疆野苹果响应NaCl胁迫相关基因.[方法]以新疆野苹果组培苗为试验材料,对150 mmol· L-1NaCl处理48 h后的新疆野苹果幼苗叶片及根系进行转录组测序.[结果]与对照相比,NaCl处理48 h时,新疆野苹果幼苗叶片中差异表达基因为3 364个,其中1 745个DEGs在盐胁迫响应中上调表达,1 619个DEGs下调表达;根系中差异表达基因为3 808个,其中1 057个DEGs在盐胁迫响应中上调表达,2 751个DEGs下调表达.新疆野苹果叶片和根系中所共有的差异基因有2 095个得到注释,这些基因共涉及44个Pathway,富集最显著的Pathway主要有糖酵解/糖异生、磷酸戊糖途径、果糖和甘露糖代谢、丙酮酸代谢等.[结论]通过转录组测序和qRT-PCR验证发现,新疆野苹果受到NaCl胁迫后,在糖酵解过程中TPI、FBPase、pckA、PPDK等基因表达量发生明显变化,说明糖酵解途径在新疆野苹果应答NaCl胁迫过程中起着一定的作用.

关键词：新疆野苹果、NaCl胁迫、转录组测序、糖酵解

所属期刊栏目：37

分类号：S661.1(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金委NSFC-新疆联合基金培育项目U1703116

在线出版日期：2020-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：951-961