甜瓜自毒胁迫响应基因CmFe-SOD的克隆及表达分析
[目的]克隆根系分泌物介导的甜瓜自毒胁迫响应基因Fe-SOD,分析基因序列特征和表达情况,探讨其功能.[方法]以甜瓜幼苗为材料,通过RT-PCR技术克隆Fe-SOD基因,命名为CmFe-SOD,进行生物信息学分析和亚细胞定位;通过qRT-PCR技术分析CmFe-SOD在自毒胁迫后甜瓜幼苗叶片和根系中的表达模式.[结果]CmFe-SOD基因组DNA全长1 255 bp,开放阅读框918 bp,编码305个氨基酸.生物信息学分析显示CmFe-SOD为酸性亲水蛋白,无信号肽和跨膜区域,二级结构中无规则卷曲比例最高,与三级结构预测结果一致,基因序列包含典型的Fe-SOD蛋白结构域.同源性分析表明,不同来源Fe-SOD在氨基酸序列上具有较高同源性,CmFe-SOD蛋白与黄瓜的关系较近.通过洋葱内表皮GFP荧光定位观察发现,CmFe-SOD定位于细胞质;qRT-PCR结果显示,根系分泌物处理后甜瓜幼苗叶片中CmFe-SOD基因表达水平整体呈增加趋势,在24h时表达量最高;在根系中呈现先增加后下降趋势,6h时表达量最高.[结论]CmFe-SOD基因在进化上较保守,参与了甜瓜根系分泌物介导的自毒胁迫响应,自毒胁迫后在叶片中表达量呈持续上升的趋势,在根部呈现先上升后下降的趋势.
甜瓜、自毒胁迫、根系分泌物、Fe-SOD基因、亚细胞定位、qRT-PCR
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S652(瓜果园艺)
国家重大农技推广服务试点项目KNJ-152046;福建农林大学创新专项基金CXZX2016108,CXZX2017168;福建农林大学园艺学院青年学术骨干培养基金
2018-12-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
1335-1343
