龙眼miR172家族成员进化特性及其时空表达分析
[目的]研究龙眼miR172家族的进化特性及其在龙眼不同组织部位中的表达模式.[方法]采用生物信息学分析及实时荧光定量PCR的方法,对龙眼miR172家族5条前体(pre-miR172)序列及1条成熟体序列进行分析,并预测其前体二级结构,构建系统发育进化树,预测靶基因及分析不同组织部位的定量表达情况.[结果]对龙眼miR172家族5条前体序列进行多序列比对,发现miR172家族两端相对保守,中间区域则形成各自的特异性区域.对miR172家族5条前体及1条成熟体进行多序列比对,发现6条序列间存在1个约20个碱基的保守区域,推测该区域可能为miR172家族成熟体所在区域.Mfold软件预测结果显示,pre-miR172家族成员均能形成典型的茎环二级结构,其最小折叠自由能为-35.80～-54.45 kal· mol-1,较为稳定.系统发育进化树结果显示,龙眼pre-miR172家族成员与甜橙、毛果杨等植物的miR172亲缘关系较近.靶基因预测结果显示,龙眼miR172a的靶基因包括AP2、蝶呤型钼辅因子(molybdopterin cofactor)、谷氨酰-tRNA(glutamyl-tRNA)、假定蛋白(hypothetical protein)等.实时荧光定量PCR结果显示,miR172家族各成员在龙眼不同组织部位中的表达模式总体相似,均在叶芽和生殖生长阶段中大量表达,在营养生长阶段及果实中表达量则较低,但dlo-miR172-scaffold4293特异地在叶片中高表达.[结论]龙眼miR172家族在进化过程中保守性与特异性并存,且可能参与了龙眼部分器官的形成及发育过程.
龙眼、miR172家族、进化特性、实时荧光定量PCR
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S667.2(果树园艺)
福建省自然科学基金杰出青年项目2015J06004;国家自然科学基金31672127,31572088;福建省重大专项2015NZ0002-1;福建省新世纪人才项目20151104;福建农林大学“杰出青年科研人才”培养专项基金xjq201405
2017-12-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
1385-1393
