基于p23基因的野生柑橘和栽培柑橘上衰退病毒分离株间的遗传特征分析
[目的]比较分析野生柑橘与栽培柑橘上衰退病毒(CTV)分离株间的分子遗传特征,为深入解析CTV的遗传进化提供相关依据.[方法]运用RT-PCR对我国云南、广西、四川、湖南、江西等省(区)的11个野生柑橘上的CTV分离株和4个国内栽培甜橙及柚上的CTV强弱毒代表株分离株的p23基因进行扩增、测序,所获序列与GenBank收录的具有代表性的国外CTV分离株的相应基因序列进行比对分析.[结果]野生柑橘与国内外栽培柑橘上CTV分离株的p23基因序列相似率为87.7％～99.3％;密码子中碱基含量GC％＜AT％,密码子转换数多于颠换数,第3位的碱基替换数最多,其次为第1位,最少是第2位;非同义突变与同义突变的比值(dN/ds)小于1,表明p23基因在进化过程中承受着净化选择.系统聚类分析表明,来自于野生柑橘上的11个CTV分离株在构建的系统发育树中分属不同的簇支,与不同来源地具有较高相似性和较低遗传距离的栽培柑橘上的CTV分离株构成同一组群.[结论]野生柑橘与栽培柑橘上的CTV分离株在碱基含量、密码子转换和颠换率及非同义突变与同义突变比值(dN/ds)等遗传特征方面均表现出一致性,系统发育分析表明,野生柑橘上CTV分离株基于p23基因序列的聚类关系与其地理来源之间无明显相关性.
野生柑橘、栽培柑橘、柑橘衰退病毒、p23基因、遗传特征
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S666(果树园艺)
国家自然科学基金30900977;江西省自然科学基金20142BAB204010;江西省高等学校科技落地项目KJLD13079;江西省重点研发项目20161BBF60070
2017-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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