草莓EST-SSR标记的开发与应用
从公共数据库中下载61 731条草莓表达序列标签（Expressed Sequence Tag,EST）,组装后得到系列非冗余EST 14 948条,总长度为9 969.35 kb,挖掘到1 807个SSR,分布在1 515条序列上,发生频率为10.14%,平均每5.52kb出现1个SSR（Simple Sequence Repeat）。其中,235条系列包含2个或2个以上SSR,76个SSR以复合形式出现。二核苷酸（794个SSR）和三核苷酸（795个SSR）是主要的类型,所占比例分别为43.94%和44.00%。AG/CT（691个）和AAG/CTT（278个）在二、三核苷酸中占主导地位。利用这些序列,设计47对引物,对生产上主栽的3个日本品种进行多态性研究,44对引物有扩增产物,6对表现多态性。结果表明,从草莓相关EST数据库中开发的EST-SSR引物可行且有用,在草莓品种鉴定、种质资源分析、遗传作图等研究方面有广阔的应用前景。
草莓、EST-SSR、标记开发
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S668.4(果树园艺)
农业部行业计划201003064;江苏省科技基础设施建设计划BM2008008
2012-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
721-726
