高效检测板栗群体基因频率方法的建立

摘要：

以17个板栗群体为试材,采用ABI全自动遗传分析仪,利用5'端荧光标记的SSR引物,通过混合样本中PCR产物检测峰高与丰度对应,分析基因频率,建立板栗群体混合样本等位基因及其频率的分析方法.与聚丙烯酰胺凝胶电泳银染法相比,ABI全自动遗传分析仪的检测灵敏度高,荧光引物CmTCR10(NED)共检测到78个等位基因,平均每个群体4.6个;引物CmTCR24(6-FAM)检测到41个等位基因,平均每个群体2.4个.多重PCR荧光SSR检测结果显示,可以明确区分不同的等位基因.荧光SSR能准确地读出片段大小,定量PCR扩增产物的丰度.用GeneScan获取数据,用Genotyper软件对数据进行设置与输出,使用R软件的FREQS-R模块,初步探讨利用荧光SSR定量化数据,计算供试群体混合样本的等位基因频率,可通过荧光SSR产物的丰度来确定混合取样群体的基因频率.

关键词：板栗群体、SSR、多重PCR、混和样本、基因频率

所属期刊栏目：28

分类号：S664.2(果树园艺)

资助基金：山东省农业良种工程20l0lz010;国家科技支撑计划2008BAD92B03

在线出版日期：2011-05-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：176-181