DNA测序信号去噪分析的一种新方法

摘要：

在DNA荧光测序中,噪声会影响分析的准确度和检出限.相比其他滤波方法,小波分析具有良好的时频域分辨特性.在小波去噪处理中,正确选择合适的小波基函数、去噪阈值和分解层数直接关系到信号去噪处理的质量.为了真实构建噪声模型并准确评价去噪算法的有效性,实验中通过实际系统中采集到的噪声信号叠加理想荧光信号构建DNA测序仿真信号,去噪分析的结果表明:选择sym7小波基函数、分解层数(lev=5)与使用固定格式软阈值,有效去除了DNA测序信号的噪声;处理后,信号的信噪比提高了5倍以上.将其用于处理实际的DNA电泳荧光信号,相比基于随机噪声模型的算法,去噪后的信号更加真实可靠.

关键词：DNA测序、荧光信号、小波分析、去噪

所属期刊栏目：28

分类号：TH74;TP391(仪器、仪表)

资助基金：国家自然科学基金项目60378042

在线出版日期：2008-08-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1126-1129