10.13448/j.cnki.jalre.2022.207
包头市九峰山青海云杉根系内生真菌的多样性及群落构建机制-基于三代测序技术
植物内生真菌对植物的生长发育具有非常重要的作用.文中以包头市九峰山青海云杉为研究对象,基于Pacbio公司的三代测序技术-单分子实时测序(Single Molecule Real Time Sequencing,SMRT)对青海云杉根系内生真菌的内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,ITS)全长片段进行测序,检测青海云杉根系内生真菌的多样性和群落组成,并探究内生真菌的群落构建机制.文中共检测获得166个内生真菌可操纵分类单元(Operational Taxonomic Units,OTU),在门的分类水平上,子囊菌(Ascomycota)是最为优势的真菌类群,在科的水平上,柔膜菌科(Helotiaceae)最为优势,此外,139个OTU(占比83.7%)能够被鉴定到属的水平,133个OUT(占比80.1%)被鉴定到种的水平,其中四枝孢属(Tetracladium)是最优势的真菌属,同时,常见的内生真菌如Fusarium oxysporum,Aspergillus flavus和Trichoderma atroviride在文中也被检测出来.中性模型和过程性分析显示,内生真菌的群落构建主要是由随机性过程中的扩散限制所驱动.文中研究表明青海云杉根系具有丰富的内生真菌多样性,扩散限制主导了内生真菌的群落构建.研究为进一步探究青海云杉有益内生真菌资源及其功能利用等提供一定的理论依据.
青海云杉、内生真菌、Pacbio SMRT三代测序、扩散限制
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Q949.32(植物学)
内蒙古自然科学基金项目;包头市青年创新人才项目;内蒙古自治区级大学生创新创业计划训练项目
2022-08-11(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共6页
119-124