转录组和iTRAQ技术联合揭示玉米根系的耐旱机制

摘要：

采用RNA-Seq技术和iTRAQ技术对耐旱性不同的两玉米自交系(昌7-2和TS141)的幼苗根系差异基因(DEGs)和差异蛋白(DEPs)进行关联分析.定量关联分析结果表明,Chang 7-2 D1 vs CK1、Chang 7-2 D2 vs CK2、TS141 D1 vs CK1和TS141 D2 vs CK2等4个比较组中mRNA和蛋白表达趋势相同的基因相关系数分别为0.7993、0.5673、0.6406、0.6588,mRNA和蛋白表达趋势相反的基因相关系数分别为-0.7222、-0.5752、-0.7996、-0.7339;此外,通过对每个自交系的D1 vs CK1和D2 vs CK2关联结果进行整合后发现,在干旱胁迫下,昌7-2中mRNA和蛋白表达趋势相同的基因有19个,mRNA和蛋白表达趋势相反的基因有9个,TS141中mRNA和蛋白表达趋势相同的基因有11个,mRNA和蛋白表达趋势相反的基因有0个,表明植物根系在转录和转录后调控过程中存在差异.KEGG分析发现4个比较组所关联到的DEGs/DEPs主要涉及苯丙素的生物合成、次生代谢产物的生物合成和核糖体等,这些通路可能是不同自交系幼苗根系共同响应干旱胁迫的主要通路.在昌7-2和TS141中挑选9个DEPs/DEGs表达趋势相同的基因进行qRT-PCR分析表明,9个DEPs/DEGs的表达趋势与它们的RNA-Seq和iTRAQ结果基本一致.

关键词：玉米、根系、转录组、蛋白质组、关联分析、耐旱机制

所属期刊栏目：40

分类号：S513;Q945.78(禾谷类作物)

资助基金：国家玉米产业技术体系项目XZ20200810

在线出版日期：2022-04-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：59-68