基于DTM-PCR、MIRU-VNTR和耐药基因测序的武汉市耐多药结核分枝杆菌的分子分型

摘要：

目的 描述武汉市耐多药结核(multidrug-resistant tuberculosis,MDR-TB)分枝杆菌基因型分布及成簇特征.方法 采用目标缺失多重PCR(Deletion-Targeted Multiplex,DTM-PCR)、24位点MIRU-VNTR(mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat typing)以及耐药基因测序方法,对武汉市149株耐多药结核分枝杆菌进行分子分型,计算Hunter-Gaston分辨指数(Hunter-Gaston discriminatory index,HGDI),成簇率以及近期感染率最小估计值.结果 全部MIRU位点的累积HGDI为0.9944.QUB11b位点的HGDI最高(0.6738).联合采用DTM-PCR以及MIRU-VNTR,共鉴定出111个独立基因型和11个成簇基因型(38株),成簇率为25.50％,近期感染率最小估计为18.12％.经过耐药基因测序进一步分型,各簇内共有17(44.74％)个菌株有相同的突变位点,其余21个菌株突变位点不相同.结论 联合采用DTM-PCR、24位点MIRU-VNTR分型和耐药基因测序,其基因分型分辨率较高,适合于武汉地区耐多药结核分枝杆菌的基因分型.武汉市MDR-TB的发生大多由于内源性复燃引起,但仍有一定的近期传播率.

关键词：分枝杆菌;结核;广泛耐药结核;基因型

所属期刊栏目：32

分类号：R181.2(流行病学与防疫)

资助基金：湖北省自然科学基金;湖北省卫健委项目;武汉市卫健委项目;北京医卫健康公益基金会课题;武汉市卫计委项目

在线出版日期：2021-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：38-42