在不同溶剂体系中PC脂肪酶对PBS基共聚物的催化降解和分子模拟

摘要：

采用酶促降解实验、分子对接模拟和分子动力学模拟相结合的方法,分别研究了在氯仿和水溶剂体系中洋葱假单胞菌脂肪酶(Pseudomonas cepacia lipase PC)对含六元环结构的1,4-环己烷二甲醇(CHDM)、1,4环己烷二甲酸(CHDA)、含醚键结构的一缩二乙二醇(DEG)和二乙醇酸(DGA)单体的聚丁二酸丁二醇酯(PBS)改性共聚物的降解规律,并对它们进行了比较,阐明了PC脂肪酶与不同底物的结合机制及其降解差异性.结果表明:PC脂肪酶可有效地催化降解不同结构的PBS基共聚物,氯仿中酶与底物结合自由能的大小顺序为CMSCM＞ DGSDG＞ BDAB＞ BCAB＞BSB,水中二者的结合自由能大小顺序为CMSCM＞ DGSDG＞BCAB＞ BDAB＞ BSB,其中CM单元的六元环状亚甲基的富集作用使得底物与酶活性位点的对接最为稳定,具有较大的结合能,且PBS-coCHDMS降解率最大.受溶剂效应影响,酶与底物在氯仿中的结合更稳定,降解率远大于在水中的降解率.

关键词：洋葱假单胞菌脂肪酶、PBS基共聚物、酶促降解、溶剂效应、分子模拟

资助基金：高等学校博士学科点专项科研基金20126125110001;“十二五”国家863计划项目2011AA100503;

在线出版日期：2015-01-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：141-148