肺炎克雷伯菌质粒pIMP26_DQ49的高通量测序分析

摘要：

目的 通过对肺炎克雷伯菌DQ49耐药质粒pIMP26_DQ49的测序及分析,研究其与肺炎克雷伯菌耐药的关系.方法 利用多位点序列分型技术(MLST)检测肺炎克雷伯菌DQ49的序列分型(ST),通过接合实验得到携带耐药基因blaIMP-26的质粒pIMP26_DQ49,利用Illumina Miseq 高通量测序平台对该质粒进行测序,得到的数据用Edena 软件拼接,并利用RAST网上注释工具对得到的质粒全序列进行注释,同时使用网上序列比对工具BLAST进行分析.结果 MLST分析该菌的ST型为新的ST型ST2460(基因型42-22-26-96-233-38-51);接合实验证明该质粒能通过接合转移进行传播;测序结果表明,pIMP26_DQ49属于质粒不相容群(Inc)中的IncN群,是大小为55179 bp的环状质粒,携带3个耐药基因,G+C含量为50.4%,预测编码52个功能基因.BLAST发现pIMP26_DQ49与已报道的pIMP_HZ1序列相似度高达99%,且携带的可移动基因元件也高度相似,其耐药基因环境包含可导致转座事件发生的IS903D、IS2、Tn2、Tn3、tnp、tnpA,以及能捕获和整合外源性基因的1类整合子基因intl1.结论 质粒pIMP26_DQ49携带超广谱β-内酰胺酶基因blaTEM-1、喹诺酮耐药基因qnrS1和金属型碳青霉烯酶基因 blaIMP-26,其存在可能对相应的耐药基因在肠杆菌科细菌中的传播发挥重要作用.

关键词：肺炎克雷伯菌、碳青霉烯酶、pIMP26-DQ49、blaIMP-26

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在线出版日期：2018-03-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：71-75